-
Genbank格式的基因序列绘制基因的结构图
应用背景
NCBI上很多基因组DNA序列都有结构描述,其中关于内含子结构的描述通常是 CDS join(1..193,290..1284),表示两个外显子,中间一个是内含子位置,有些基因组DNA更复杂,内含子数目可能达到10个以上,看起来眼花缭乱。很多研究者希望把这些结构信息以图形的形式展示,一目了然,容易分析。用这个perl脚本可以方便的绘制图形,只需要把序列下载下来,输入一个命令自动绘图成功!
关键技术
计算机条件:linux系统,我是在ubuntu系统上使用的。网上下载bioperl 安装。安装很简单,bioperl下载后解压到一个盘上,形成一个文件夹。安装Bio::Graphics的方法,在ubuntu的命令行下输入 sudo perl -MCPAN -e"install Bio::Graphics" 即可自动安装。在Ubuntu安装了bioperl,Bio::Graphics后,可以cd到这些perl脚本和文件所在的文件夹下,在linux终端输入命令行, genbankplot.pl NM_172587.gb >1.png,得到的png图像双击就打开,是基因的结构图!!!注意先把NM_172587.gb 这个genbank下载的文件拷贝到bioperl文件夹下。得到的图就像1.png。
- 2022-02-10 02:56:54下载
- 积分:1
-
ASP.NET binary stream from the RDB display multiple picture! A IMAGEBUTTON displ...
ASP.NET 从RDB二进制流显示多个图片!一个IMAGEBUTTON显示不同的图片.-ASP.NET binary stream from the RDB display multiple picture! A IMAGEBUTTON display a different image.
- 2022-06-01 05:47:54下载
- 积分:1
-
这是一个做美国国旗的程序,可以实现国旗的票动效果
这是一个做美国国旗的程序,可以实现国旗的票动效果-This is a flag of the United States to do procedures, the national flag can be achieved dynamic effects of votes
- 2022-07-25 08:34:24下载
- 积分:1
-
This library implements the KLT Tracking algorithm [2004] for Feature Tracking i...
This library implements the KLT Tracking algorithm [2004] for Feature Tracking in Video useful in computer vision tasks like object recognition, image indexing, tracking and structure from motion. This implementation uses programmable Graphics Hardware to achieve considerable speedup in the running time of the GPU-based implementation.
- 2023-06-29 20:25:03下载
- 积分:1
-
introduction.to.direct3d9中文版(?士兵版)书附带..
Introduction.To.Direct3D9中文版(翁云兵版)书附带源码-Introduction.To.Direct3D9 Chinese version (??soldiers Edition) book incidental source
- 2022-06-30 18:59:15下载
- 积分:1
-
Compilation of complex shapes on the window asm source, although the code less,...
汇编的 关于 复杂形状的窗口 的asm 源程序,虽然代码量少,但汇编语言本来就是很精练的-Compilation of complex shapes on the window asm source, although the code less, but the assembly language is the very concise
- 2022-05-23 07:59:01下载
- 积分:1
-
of geographic data conversion for two
将地理DEM数据转换为2维图形-of geographic data conversion for two-dimensional graphics
- 2022-02-09 23:59:30下载
- 积分:1
-
Qt opencv kalman 跟踪
本例实现了基于Qt———C++ GUI类库的kalman跟踪算法,用到了opencv的相关类,代码注释详细,几乎每两行就有注解,简单易懂!
- 2022-04-21 13:00:23下载
- 积分:1
-
一个我以前做的cad的程序的源代码,可以参考下做法。
一个我以前做的cad的程序的源代码,可以参考下做法。-I used to do a cad of the program
- 2022-02-05 18:47:29下载
- 积分:1
-
Sobel和Kirsch的边缘检测算法
Sobel和Kirsch的边缘检测算法-Sobel Edge Detection Algorithm
- 2023-04-06 09:00:04下载
- 积分:1