-
Genbank格式的基因序列绘制基因的结构图
应用背景
NCBI上很多基因组DNA序列都有结构描述,其中关于内含子结构的描述通常是 CDS join(1..193,290..1284),表示两个外显子,中间一个是内含子位置,有些基因组DNA更复杂,内含子数目可能达到10个以上,看起来眼花缭乱。很多研究者希望把这些结构信息以图形的形式展示,一目了然,容易分析。用这个perl脚本可以方便的绘制图形,只需要把序列下载下来,输入一个命令自动绘图成功!
关键技术
计算机条件:linux系统,我是在ubuntu系统上使用的。网上下载bioperl 安装。安装很简单,bioperl下载后解压到一个盘上,形成一个文件夹。安装Bio::Graphics的方法,在ubuntu的命令行下输入 sudo perl -MCPAN -e"install Bio::Graphics" 即可自动安装。在Ubuntu安装了bioperl,Bio::Graphics后,可以cd到这些perl脚本和文件所在的文件夹下,在linux终端输入命令行, genbankplot.pl NM_172587.gb >1.png,得到的png图像双击就打开,是基因的结构图!!!注意先把NM_172587.gb 这个genbank下载的文件拷贝到bioperl文件夹下。得到的图就像1.png。
- 2022-02-10 02:56:54下载
- 积分:1
-
是txt格式的,win大师游戏编程中的
是txt格式的,win大师游戏编程中的-Txt format is, win the game Master of the Eastern Programming
- 2023-06-13 12:20:03下载
- 积分:1
-
用matlab 实现的 噪声添加函数代码。
用matlab 实现的 噪声添加函数代码。-Matlab implementation of the noise used to add function code.
- 2023-01-26 19:45:03下载
- 积分:1
-
夕阳醉了 一个用FLASH MX编的小程序
夕阳醉了 一个用FLASH MX编的小程序-sunset of a drunk with Flash MX series of small programs
- 2022-05-16 06:44:27下载
- 积分:1
-
这次做的不是很完美,希望得到大家的指教:)运行后在右方的“球色”处可以改变球色,但R,G,B三个数值的和最好不要超过255,有不妥之处请大家原谅。...
这次做的不是很完美,希望得到大家的指教:)运行后在右方的“球色”处可以改变球色,但R,G,B三个数值的和最好不要超过255,有不妥之处请大家原谅。-this is not so perfect, we all hope the exhibitions :) after running in front of the "ball color," the ball can change the color, but the R, G, B 3 numerical and preferably not more than 255, there is nothing wrong with it please forgive me.
- 2022-05-14 08:25:27下载
- 积分:1
-
这个小东西WPF开发,开放
WPF 开发的小东西 ,公开本源码!通过调节滚动条实时改变颜色!-WPF development of the small things, the open-source! Rolling through the adjustment of the real-time change in color!
- 2022-03-21 03:05:39下载
- 积分:1
-
学校指导地图实现
学校导游图的实现-schools guide map to achieve
- 2022-03-25 23:40:46下载
- 积分:1
-
divcsschinamap
div和css形成的中国地图。很实用的
大家可以学习定位-divcsschinamap
- 2022-04-28 12:50:44下载
- 积分:1
-
用于连续图像拼接,模板匹配算法
用于对两幅连续图像进行拼接,模板匹配算法-used for two consecutive image stitching, template matching algorithm
- 2022-03-25 09:35:10下载
- 积分:1
-
OpenGL矢量矩阵库
为OpenGL开发的矢量和矩阵库,非常有用,类名源于GLSL
如vec3 vec4 mat3 mat4
- 2022-04-28 09:02:59下载
- 积分:1