-
Genbank格式的基因序列绘制基因的结构图
应用背景
NCBI上很多基因组DNA序列都有结构描述,其中关于内含子结构的描述通常是 CDS join(1..193,290..1284),表示两个外显子,中间一个是内含子位置,有些基因组DNA更复杂,内含子数目可能达到10个以上,看起来眼花缭乱。很多研究者希望把这些结构信息以图形的形式展示,一目了然,容易分析。用这个perl脚本可以方便的绘制图形,只需要把序列下载下来,输入一个命令自动绘图成功!
关键技术
计算机条件:linux系统,我是在ubuntu系统上使用的。网上下载bioperl 安装。安装很简单,bioperl下载后解压到一个盘上,形成一个文件夹。安装Bio::Graphics的方法,在ubuntu的命令行下输入 sudo perl -MCPAN -e"install Bio::Graphics" 即可自动安装。在Ubuntu安装了bioperl,Bio::Graphics后,可以cd到这些perl脚本和文件所在的文件夹下,在linux终端输入命令行, genbankplot.pl NM_172587.gb >1.png,得到的png图像双击就打开,是基因的结构图!!!注意先把NM_172587.gb 这个genbank下载的文件拷贝到bioperl文件夹下。得到的图就像1.png。
- 2022-02-10 02:56:54下载
- 积分:1
-
一篇关于行人检测的文件 经典大家可以看看
学习下
一篇关于行人检测的文件 经典大家可以看看
学习下-Pedestrian Detection on a document everyone can look at the classic study of
- 2022-04-02 05:11:38下载
- 积分:1
-
将BMP格式转换成YUV格式,里面有例子,很好的。
将BMP格式转换成YUV格式,里面有例子,很好的。
- 2023-01-25 22:20:04下载
- 积分:1
-
一个很有意思的不规则区域填充
一个很有意思的不规则区域填充-a very interesting regional anomalies filled
- 2022-11-29 11:35:04下载
- 积分:1
-
这是一个手写鉴别系统实例源程序,算法简单实用!
这是一个手写鉴别系统实例源程序,算法简单实用!-This is a instance source program of handwritten recognition system, the arithmetic is briefness and utility!
- 2022-11-08 03:50:02下载
- 积分:1
-
识别选定图片表情
vc和opencv写的识别选定图片的程序,详细识别步骤-眼--鼻--嘴debug可用
- 2022-07-09 14:14:24下载
- 积分:1
-
particularly applicable to beginners of Java source code, is a standard algorith...
特别适用于JAVA初学者的源代码,都是标准算法-particularly applicable to beginners of Java source code, is a standard algorithm
- 2022-04-09 12:58:25下载
- 积分:1
-
A menu interface, respectively, using the menu command to map the original data...
一个菜单界面,分别用菜单命令来绘制原数据曲面图,线性插值,最近点插值,3次多项式插值,3次样条插值后的图形,每次插值都可以在同一图形界面下比较插值前后图形。-A menu interface, respectively, using the menu command to map the original data surface map, linear interpolation, nearest point interpolation, polynomial interpolation 3 times, 3 times after spline graphics, interpolation can be per- under the same graphical interface graphics compared before and after interpolation.
- 2022-11-06 10:45:04下载
- 积分:1
-
jpeg图像编/解码
jpeg图像编/解码-jpeg picture arranges/decodes
- 2022-01-24 10:22:09下载
- 积分:1
-
自己写的一个用java3d制作的模拟伞的收缩动作的小程序。
自己写的一个用java3d制作的模拟伞的收缩动作的小程序。-wrote it myself with a java3d umbrella of the simulated action of the contraction of small procedures.
- 2023-08-29 10:15:04下载
- 积分:1