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Genbank格式的基因序列绘制基因的结构图
应用背景
NCBI上很多基因组DNA序列都有结构描述,其中关于内含子结构的描述通常是 CDS join(1..193,290..1284),表示两个外显子,中间一个是内含子位置,有些基因组DNA更复杂,内含子数目可能达到10个以上,看起来眼花缭乱。很多研究者希望把这些结构信息以图形的形式展示,一目了然,容易分析。用这个perl脚本可以方便的绘制图形,只需要把序列下载下来,输入一个命令自动绘图成功!
关键技术
计算机条件:linux系统,我是在ubuntu系统上使用的。网上下载bioperl 安装。安装很简单,bioperl下载后解压到一个盘上,形成一个文件夹。安装Bio::Graphics的方法,在ubuntu的命令行下输入 sudo perl -MCPAN -e"install Bio::Graphics" 即可自动安装。在Ubuntu安装了bioperl,Bio::Graphics后,可以cd到这些perl脚本和文件所在的文件夹下,在linux终端输入命令行, genbankplot.pl NM_172587.gb >1.png,得到的png图像双击就打开,是基因的结构图!!!注意先把NM_172587.gb 这个genbank下载的文件拷贝到bioperl文件夹下。得到的图就像1.png。
- 2022-02-10 02:56:54下载
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- 2022-03-14 20:29:15下载
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这个Matlab程序使用eigenface系统实现人脸识别,它使用AT&T的数据库,运行代码实例前,请阅读其中的comment,下载该数据库。-Matlab program uses the eigenface face recognition system, which uses AT
- 2023-01-12 02:50:03下载
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图象的冲击滤波程序,用于图象增强,用MATLAB语言编写-image filtering impact procedures for image enhancement, using MATLAB language
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用C语言编出来的饿一个非常没的图案- Hungry extremely no design writes which with the C language
- 2022-07-07 17:42:28下载
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c语言实现DDA画线法。有详细注释!-DDA painting method. Detailed Notes!
- 2022-12-05 15:55:02下载
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关于几何图形的源码-on the geometry of the source
- 2022-02-02 19:23:30下载
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用VB也可以模拟出一个全3D的场景,这段代码只是一个简单的实例....
用VB也可以模拟出一个全3D的场景,这段代码只是一个简单的实例.-VB can also simulate a full 3D scenes, this code is just a simple example.
- 2022-08-16 00:53:57下载
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柱状图
灯光定位
向量场的绘制
视角的调整
片状图
图形的隐藏属性
21PEAKS函数曲线...
柱状图
灯光定位
向量场的绘制
视角的调整
片状图
图形的隐藏属性
21PEAKS函数曲线
-Vector Field Histogram light positioning perspective drawing sheet adjust graphics hidden property 21PEAKS function curve
- 2022-02-16 04:33:09下载
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