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Genbank格式的基因序列绘制基因的结构图
应用背景
NCBI上很多基因组DNA序列都有结构描述,其中关于内含子结构的描述通常是 CDS join(1..193,290..1284),表示两个外显子,中间一个是内含子位置,有些基因组DNA更复杂,内含子数目可能达到10个以上,看起来眼花缭乱。很多研究者希望把这些结构信息以图形的形式展示,一目了然,容易分析。用这个perl脚本可以方便的绘制图形,只需要把序列下载下来,输入一个命令自动绘图成功!
关键技术
计算机条件:linux系统,我是在ubuntu系统上使用的。网上下载bioperl 安装。安装很简单,bioperl下载后解压到一个盘上,形成一个文件夹。安装Bio::Graphics的方法,在ubuntu的命令行下输入 sudo perl -MCPAN -e"install Bio::Graphics" 即可自动安装。在Ubuntu安装了bioperl,Bio::Graphics后,可以cd到这些perl脚本和文件所在的文件夹下,在linux终端输入命令行, genbankplot.pl NM_172587.gb >1.png,得到的png图像双击就打开,是基因的结构图!!!注意先把NM_172587.gb 这个genbank下载的文件拷贝到bioperl文件夹下。得到的图就像1.png。
- 2022-02-10 02:56:54下载
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里面是有关 图像处理的,功能比较全,包括轮廓检测 ,等等 含图像处理的常用算法-Which is related to image processing functions have full, including the contour detection, and so on with the common image processing algorithms
- 2022-01-26 00:35:34下载
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VC读取BMP图,以及经典的边缘检测算法,还包括游程编码,本程序实现了检测、提取、压缩bmp图的边缘图像。...
VC读取BMP图,以及经典的边缘检测算法,还包括游程编码,本程序实现了检测、提取、压缩bmp图的边缘图像。-VC read BMP map, and the classic edge detection algorithms, including run-length coding, the program of detection, extraction, compression bmp image map to the brink.
- 2022-10-19 15:45:03下载
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用人工神经元来识别英文字母
用人工神经元来识别英文字母-artificial neurons to identify English alphabets
- 2022-12-02 04:50:03下载
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opengl编写机器人代码
这是一个openGL的机器人行走转圈的演示程序.有详细注释.-This is a openGL walking robot moved around the demonstration program. Notes detail.
- 2022-09-26 17:05:02下载
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指针时钟原代码(非常好用!)
指针时钟原代码(非常好用!)-pointer clock source (very handy!)
- 2022-04-08 17:36:34下载
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基于神经网络的阿拉伯数字识别,效果不错!
基于神经网络的阿拉伯数字识别,效果不错!-A program of number recognition with NeroNet,good for use.
- 2022-05-30 20:32:31下载
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运动估计代码.里面有源图像和运行结果.对写论文应该有帮助
运动估计代码.里面有源图像和运行结果.对写论文应该有帮助-motion estimation code. Active inside images and results of operations. Papers should be written to help
- 2022-03-21 11:56:29下载
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linux under a short and pithy mathematical function mapping procedures, One can...
linux下一个短小精悍的数学函数绘图程序,从中可以学到如何在linux中开发GUI程序。-linux under a short and pithy mathematical function mapping procedures, One can learn how to linux GUI developed procedures.
- 2023-05-20 17:30:03下载
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本程序使用DrawBeziers方法绘制贝赛尔样条,一个很好的例子绝对值得收藏...
本程序使用DrawBeziers方法绘制贝赛尔样条,一个很好的例子绝对值得收藏-procedures for the use of the method of mapping Bessel DrawBeziers kind of a good example worthy collection
- 2022-01-25 21:29:47下载
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